1、产业结构不合理
企业规模较小，产业集中度低，环境服务业比重偏低，全方位服务体系尚未建立、而一些企业的实践似乎已经印证了这样的观点。据悉，原先只生产环境监测仪器的河北先河环保，已经将业务扩展至提供监测服务。“他们利用自己的产品和技术手段，为山东提供全省大气、水质量监测和技术管理服务。”
2、政策机制不完善
优惠政策不配套，现有政策没有执行到位;法律法规不健全，缺乏执行力;资金投入不足，企业融资难度大。在未来， 环境监测引入社会化服务也已经成为环境管理机制创新的重要内容，被环境保护主管部门提上重要议事日程，稳步加以推进。
3、技术创新能力不强
以企业为主体的环保技术创新体系不完善，产学研结合不够紧密，技术开发投入不足，一些核心技术尚未完全掌握，部分关键设备依靠进口
4、市场不规范
地方保护、低价低质恶性竞争现象尤为严重，污染治理设施重建设、轻管理，设施运行效率和绩效不高。市场化程度低，市场调控作用没有充分发挥
