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《环境微生物宏基因组检测 高通量测序法》意见征集

时间:2020-03-26 15:47来源:金利仪器 作者:金利仪器 点击:
随着人们对环境微生物认识的不断加深,在 环境监测 、治理,工、农业生产及健康评估、疾病诊断等领域,微生物的重要性正在不断凸显,对环境中微生物的种类与丰度进行定性、定量检测也成了科学研究与实践应用的基础,并直接关系着科研结果的可信度与生产应用
  

       随着人们对环境微生物认识的不断加深,在环境监测、治理,工、农业生产及健康评估、疾病诊断等领域,微生物的重要性正在不断凸显,对环境中微生物的种类与丰度进行定性、定量检测也成了科学研究与实践应用的基础,并直接关系着科研结果的可信度与生产应用的可靠性。

 
  高通量测序技术的快速发展使得目前对环境微生物的研究摆脱了对于微生物培养技术的依赖,但目前国内并没有相对应的检测标准出台,复杂的环境微生物群落,不规范的检测方法,也造成了检测数据的混乱及结论、结果的矛盾。为了确保高通量测序技术的有序应用,深圳华大基因科技有限公司、深圳基因产学研资联盟、中国测试技术研究院、深圳华大临床检验中心在国家标准化管理委员会的主管下,起草编制了《环境微生物宏基因组检测 高通量测序法》。
 
  经过技术调研、咨询、收集和消化有关资料,结合环境微生物宏基因组检测方法及高通量测序技术的应用,编制组遵循统一性、协调性、适用性、一致性、规范性的原则,本着先进性、科学性、合理性和可操作性的原则,依据GB/T 1.1-2009《标准化工作导则 第1部分:标准的结构和编写》给出的规则并参照了GB/T 20001.4—2015《标准编写规则 第4部分:实验方法标准》,在引用了GB/T 6682《分析试验室用水规格和实验方法》、GB 19489-2008《实验室生物安全通用要求》、GB/T 19495.5-2004《转基因产品检测核酸定量 PCR检测方法》、GB/T 30989-2014《高通量基因测序技术规程》、GB/T 35537-2017《高通量基因测序结果评价要求》等文件后,规定了基于高通量测序进行环境微生物宏基因组检测的主要内容,包括样品采集、保存和运输,实验室样品接收与处理,微生物DNA样品的制备,提取后DNA样品判断质量,后续文库构建与高通量测序,数据质控要求,数据处理过程,结果与报告。
 
  阅读征求意见稿后可知,标准中所规定的检测存在于环境样本中微生物的方法原理是,先运用高通量测序技术对环境样品中微生物的总体遗传物质进行测序,然后通过测序结果与现有数据库中序列的比对来检测样品中所含的微生物的种类和相对丰度。而该方法需要高通量测序仪、PCR仪、冷冻离心机、微量移液器、紫外分光光度计、电泳仪、凝胶成像系统、水浴锅、低温冰箱等设备。
 
  相信本标准的建立和普及不仅能够规范和统一高通量测序的环境微生物检测技术流程,还能让健康、环境、农业等涉及微生物检测的各个行业有更统一和顺畅的评估、交流语境,从而能为全民健康及工农业技术进步提供有力的保障和支持并促进科研及相关领域经济的发展。
(责任编辑:金利仪器lyh)
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